Bir Koronavirüs Projesi, Saniyede 1,5 Kentilyon Süreç Yaptı

Çin Halk Cumhuriyeti'nin Wuhan kentinde tespit edildikten sonra tüm dünyaya yayılan ve şu ana kadar 22.169 kişinin vefatına neden olan yeni ölümcül koronavirüs (COVID-19) salgınıyla çaba için birçok kurum seferber oldu. Dünya çapındaki gönüllülerin şahsî bilgisayarlarından oluşan bir sistem olan ve protein molekülleriyle ilgili simülasyonlar yapan [email protected] projesi, COVID-19'la ilgili faaliyetlerine dair bilgi verdi.

[email protected]'un açıkladığı bilgilere nazaran, sistemin toplam performansı, saniyede 1,5 kentilyon (1.500.000.000.000.000.000) sürece ulaştı. [email protected] iştirakçilerinin, dünyanın en güçlü harika bilgisayarından daha çok süreç yaptığı belirtiliyor. Bu bedeller, en süratli harika bilgisayar olan IBM'in Summit'inden yaklaşık 10 kat daha süratli.

Koronavirüsteki protein gayelerini araştırıyor

IBM'in Summit süper bilgisayarı şimdiye kadar 148,6 PetaFlop (1 PetaFLOP = 1 katrilyon süreç) suratına ulaşabilmişti. [email protected], bu devasa muvaffakiyete ulaşmak için 4,63 milyon işlemci (CPU) çekirdeği ve yaklaşık 430 bin grafik işlemci (GPU) kullanmak zorunda kaldı. Dağıtılmış hesaplama metodunun tabiatı düşünüldüğünde, yani her vakit tüm işlemci çekirdekleri ve grafik işlemcileri çevrimiçi değildir, bu durumda [email protected] projelerinin kullanabileceği performans, donanımın uygunluğuna bağlı olarak değişiyor.  

Yeni koronavirüs salgını nedeniyle çok sayıda hesaplamalı biyoloji ve kimya projesi başlatıldı. IBM, COVID-19 Yüksek Performans Hesaplama Konsorsiyumu'nu kurarak ABD'deki çeşitli araştırma kurumları ve teknoloji şirketleri tarafından kullanılan muhakkak başlı harika bilgisayarları bir ortaya getirip epidemiyoloji, biyoenformatik ve moleküler modellemede araştırma simülasyonları yapmak istiyor. Bu konsorsiyuma katılan harika bilgisayarların toplam süreç hızıysa 330 PetaFLOP.

[email protected], çeşitli hastalıklara karşı tedavi bulmak için protein dinamiklerini anlamaya çalışan bir simülasyon projesi. Son zamanlardaysa, yeni koronavirüsteki ilacın tesir edebileceği protein maksatlarını teorik olarak simüle ediyor.